SNP位點分析
【技術(shù)簡介】
(1)技術(shù)原理
SNP位點分析,是指在基因組上單個核苷酸的變異,包括轉(zhuǎn)換、顛換、缺失和插入,形成的遺傳標(biāo)記,其數(shù)量很多,多態(tài)性豐富。從理論上來看每一個SNP 位點都可以有4 種不同的變異形式,但實際上發(fā)生的只有兩種,即轉(zhuǎn)換和顛換,二者之比為2:1 。SNP 在CG序列上出現(xiàn)最為頻繁,而且多是C轉(zhuǎn)換為T ,原因是CG中的胞嘧啶常被甲基化而后自發(fā)地脫氨成為胸腺嘧啶。一般而言,SNP 是指變異頻率大于1 %的單核苷酸變異。在人類基因組中大概每1000 個堿基就有一個SNP ,人類基因組上的SNP 總量大概是3 ×106 個 。因此,SNP成為第三代遺傳標(biāo)志,人體許多表型差異、對藥物或疾病的易感性等等都可能與SNP有關(guān)。
(2)技術(shù)應(yīng)用
SNP研究是人類基因組計劃走向應(yīng)用的重要步驟。這主要是因為SNP將提供一個強有力的工具,用于高危群體的發(fā)現(xiàn)、疾病相關(guān)基因的鑒定、藥物的設(shè)計和測試以及生物學(xué)的基礎(chǔ)研究等。
【服務(wù)內(nèi)容】
根據(jù)客戶的具體情況,提供測序法檢測SNP。保證經(jīng)濟、高效地達到客戶的實驗?zāi)康?;原始電泳圖譜、儀器相關(guān)文件等原始數(shù)據(jù)和初步的分析結(jié)果。
【客戶須知及標(biāo)本要求】
(1)客戶須明確檢測目的和具體要求,最好能提供1~2篇文獻或資料。
(2)客戶須提供組織、細(xì)胞、血液等樣品材料或純化好的DNA。
(3)客戶須提供目的SNP位點的rs號或該位點上下游各200bp的序列以及突變的類型。